(KDO)-lipid IVA(5-)

HCID 25246208

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Grundinformationen

Standard-SMILES: CCCCCCCCCCC[C@@H](O)CC(=O)N[C@H]1[C@H](OC[C@H]2O[C@H](OP(=O)([O-])[O-])[C@H](NC(=O)C[C@H](O)CCCCCCCCCCC)[C@@H](OC(=O)C[C@H](O)CCCCCCCCCCC)[C@@H]2O)O[C@H](CO[C@]2(C(=O)[O-])C[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]([C@H](O)CO)O2)[C@@H](OP(=O)([O-])[O-])[C@@H]1OC(=O)C[C@H](O)CCCCCCCCCCC
InChIKey: GPNCBCJEDRRCDW-ACUQGRCXSA-I
Summenformel: C76H137N2O30P2-5
Durchschnittliche Molmasse: 1.620,8 g/mol
Monoisotopische Masse: 1.619,87313995

Überblick

(KDO)-lipid IVA(5-) is (KDO)-lipid IVA deprotonated at both phosphono groups and at the uronic acid carboxy group. It is the major species at pH 7.3. It is an a Kdo-lipid IVA(5-) and a lipid IVA oxoanion. It is a conjugate base of a (KDO)-lipid IVA.

Namen und Bezeichner

Bevorzugter Name: (KDO)-lipid IVA(5-)
IUPAC: (2R,4R,5R,6R)-6-[(1R)-1,2-dihydroxyethyl]-4,5-dihydroxy-2-[[(2R,3S,4R,5R,6R)-6-[[(2R,3S,4R,5R,6R)-3-hydroxy-5-[[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]amino]-4-[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]oxy-6-phosphonatooxyoxan-2-yl]methoxy]-5-[[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]amino]-4-[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]oxy-3-phosphonatooxyoxan-2-yl]methoxy]oxane-2-carboxylate

Namen und Synonyme

(KDO)-lipid IVA(5-)alpha-Kdo-(2->6)-lipid IVA (E. coli)(KDO)-lipid IVA (E. coli)CHEBI:60364DTXSID9013437473-Deoxy-D-manno-octulosonyl-lipid IV(A) (E. coli)Q27127217(2R,4R,5R,6R)-6-[(1R)-1,2-dihydroxyethyl]-4,5-dihydroxy-2-[[(2R,3S,4R,5R,6R)-6-[[(2R,3S,4R,5R,6R)-3-hydroxy-5-[[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]amino]-4-[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]oxy-6-phosphonatooxyoxan-2-yl]methoxy]-5-[[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]amino]-4-[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]oxy-3-phosphonatooxyoxan-2-yl]methoxy]oxane-2-carboxylate3-deoxy-alpha-D-manno-oct-2-ulopyranosyl-(2->6)-2-deoxy-2-{[(3R)-3-hydroxypentadecanoyl]amino}-3-O-[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]-4-O-phosphono-beta-D-glucopyranosyl-(1->6)-2-deoxy-3-O-[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]-2-{[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]amino}-1-O-phosphono-alpha-D-glucopyranose

Datenbank-Bezeichner

PubChem CID: 25246208
DTXSID: DTXSID901343747
ChEBI: CHEBI:60364

Eigenschaften

Berechnete Struktureigenschaften

XLogP: 12,8
Polarare Oberfläche (TPSA): 524 Å²
H-Brücken-Donoren: 11
H-Brücken-Akzeptoren: 30
Frei drehbare Bindungen: 64
Schwere Atome: 110
Formalladung: -5
Komplexität: 2.550

Zugehörige Reaktionen

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