5-(Hydroxymethyl)cytosine
Grundinformationen
- CAS
1123-95-1- Standard-SMILES
Nc1[nH]c(=O)ncc1CO- InChIKey
RYVNIFSIEDRLSJ-UHFFFAOYSA-N- Summenformel
- C5H7N3O2
- Durchschnittliche Molmasse
- 141,13 g/mol
- Monoisotopische Masse
- 141,05382648
Überblick
5-(hydroxymethyl)cytosine is a nucleobase analogue that is cytosine in which the hydrogen at position 5 is replaced by a hydroxymethyl group. It has a role as a mouse metabolite and a human metabolite. It is an aromatic primary alcohol, a pyrimidone, an aminopyrimidine and a nucleobase analogue. It is functionally related to a cytosine.
Namen und Bezeichner
- Bevorzugter Name
- 5-(Hydroxymethyl)cytosine
- IUPAC
- 6-amino-5-(hydroxymethyl)-1H-pyrimidin-2-one
- Englischer Name
- 5-Hydroxymethylcytosine
- Summenformel
- C5H7N3O2
- Molmasse
- 141.13
Namen und Synonyme
5-Hydroxymethylcytosine1123-95-15-(hydroxymethyl)cytosine4-Amino-5-(hydroxymethyl)-2(1H)-pyrimidinone6CD2RLN1NK2(1H)-Pyrimidinone, 4-amino-5-(hydroxymethyl)-DTXSID70149990NSC-27368CHEBI:767925-hydroxylmethylcytosineRefChem:102910DTXCID0072481
Weitere Namen anzeigen
5hmC5-HYDROXYMETHYLCYTOSHM-cytosine, 10 mM in DMSO5-Hydroxymethylcytosinefreebase6-amino-5-methylol-1H-pyrimidin-2-one4-amino-5-methylol-3H-pyrimidin-2-one5-(Hydroxymethyl)Cytosine Hydrochloride
4-amino-5-(hydroxymethyl)pyrimidin-2-ol6-amino-5-(hydroxymethyl)-1H-pyrimidin-2-one4-amino-5-(hydroxymethyl)pyrimidin-2(1H)-one5-HYDROXYMETHYL CYTOSINEMFCD000473695-pyrimidinemethanol, 4-amino-2-hydroxy-4-Amino-2-hydroxy-5-hydroxymethylpyrimidineHM-cytosine
Datenbank-Bezeichner
- CAS
1123-95-1- PubChem CID
- 70751
Eigenschaften
Berechnete Struktureigenschaften
- XLogP
- -1,5
- Polarare Oberfläche (TPSA)
- 87,7 Ų
- H-Brücken-Donoren
- 3
- H-Brücken-Akzeptoren
- 3
- Frei drehbare Bindungen
- 1
- Schwere Atome
- 10
- Formalladung
- 0
- Komplexität
- 219
Physikochemische Eigenschaften
- Schmelzpunkt
- 299.85 °C · >299.85°C
- Siedepunkt
- 258.15 °C · 258.15°C (rough estimate)
- Dichte
- 1.3818 · 1.3818 (rough estimate)
- Brechungsindex
- 1.619 · 1.6190 (estimate)
- storage temp.
- 2 · under inert gas (nitrogen or Argon) at 2–8 °C
- Löslichkeit
- DMSO (Sparingly), Methanol (Slightly, Heated, Sonicated)
- Aggregatzustand
- Solid
- pka
- 8.61 · 8.61±0.10(Predicted)
- Farbe
- Pale Yellow to Beige
- Major Application
- cell analysisclinical researchgeneral analyticallife science and biopharmametabolomics
- InChI
- InChI=1S/C5H7N3O2/c6-4-3(2-9)1-7-5(10)8-4/h1,9H,2H2,(H3,6,7,8,10)
- InChIKey
- RYVNIFSIEDRLSJ-UHFFFAOYSA-N
- SMILES
- OCC1=CNC(N=C1N)=O
Sicherheit und Regulatorisches
Sicherheitsangaben dienen nur zur Orientierung und ersetzen weder das Sicherheitsdatenblatt (SDB) des Lieferanten noch geltende Vorschriften oder eine fachliche Bewertung.
Sicherheitsdaten
- wgk
- 3
- hs_code
- 29335990
- hazard_code
- Xi
- hazard_note
- Irritant
- safety_code
- 24/25
- Speicherklasse
- 11 - Combustible Solids
Chemie und Industrie
Anwendungen
Verwenden5-(Hydroxymethyl)cytosine is a DNA pyrimidine nitrogen base.It may regulate gene expression or prompt DNA demethylation. 5-Hydroxymethylcytosine may be especially important in the central nervous system, as it is found in very high levels there.
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