プソイドウリジンC

Pseudouridine

HCID 15047

基本情報

CAS: 1445-07-4
標準SMILES: O=c1[nH]cc([C@@H]2O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)[nH]1
InChIKey: PTJWIQPHWPFNBW-GBNDHIKLSA-N
分子式: C9H12N2O6
平均分子量: 244.2 g/mol
単同位体質量: 244.06953611

概要

Pseudouridine is a C-glycosyl pyrimidine that consists of uracil having a beta-D-ribofuranosyl residue attached at position 5. The C-glycosyl isomer of the nucleoside uridine. It has a role as a fundamental metabolite.

名称と識別子

優先名称: Pseudouridine
IUPAC: 5-[(2S,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-1H-pyrimidine-2,4-dione
現地名: プソイドウリジンC
英語名: Pseudouridine
分子式: C9H12N2O6
分子量: 244.2

名称と別名

PSEUDOURIDINE1445-07-4psi-Uridine5-(beta-D-Ribofuranosyl)uracil7R0R6H6KEG2,4(1H,3H)-Pyrimidinedione, 5-beta-D-ribofuranosyl-CHEBI:178025-[(2S,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-1H-pyrimidine-2,4-dioneNSC-1624055-[(2S,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-1,2,3,4-tetrahydropyrimidine-2,4-dione5-((2S,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl)-1H-pyrimidine-2,4-dione5-((2S,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl)-1,2,3,4-tetrahydropyrimidine-2,4-dione

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5-β-D-リボフラノシルピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオンΨ-ウリジンβ-プソイドウリジンプソイドウリジン5-(β-D-リボフラノシル)ピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン5-(β-D-リボフラノシル)-2,4(1H,3H)-ピリミジンジオン5-(β-D-リボフラノシル)ウラシル5-β-D-リボフラノシル-1,2,3,4-テトラヒドロピリミジン-2,4-ジオンシュードウリジン5-β-D-リボフラノシルウラシルプソイドウリジンC5-[(2S,3R,4S,5R)-3,4-ジヒドロキシ-5-(ヒドロキシメチル)オキソラン-2-イル]-1,2,3,4-テトラヒドロピリミジン-2,4-ジオンPseudo-UTPβ-Pseudouridiney-UridineNSC 162405PseudoruidinePseudourindinePseudouricdine

RefChem:177010978-484-6beta-Pseudouridine5-Ribosyluracilbeta-D-Pseudouridine5-((2S,3R,4S,5R)-3,4-Dihydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dionePseudouridine CPseudouridin

データベース識別子

CAS: 1445-07-4
PubChem CID: 15047
ChEMBL: CHEMBL3144027
ChEBI: CHEBI:17802
UNII: 7R0R6H6KEG
EC Number: 978-484-6
Nikkaji: J20.385H

物性

構造計算による物性

XLogP: -2.8
極性表面積: 128 Å²
水素結合供与体数: 5
水素結合受容体数: 6
回転可能結合数: 2
重原子数: 17
形式電荷: 0
複雑度: 382

実験および物理化学的性質

Physical DescriptionSolid

Collision Cross Section · 3 件

150.77 Å² [M-H]- [CCS Type: DT; Method: stepped-field]

159 Å² [M+Na]+ [CCS Type: DT; Method: single field calibrated with Agilent tune mix (Agilent)]

150.3 Å² [M-H]-

物理化学的性質

融点: 222 °C · 222 °C
比重(密度): 1.641 · 1.641±0.06 g/cm3(Predicted)
貯蔵温度: Inert atmosphere,Room Temperature
溶解性: メタノール（ごくわずか、加熱）、水（わずかに、超音波処理、加熱）
酸解離定数(Pka): 8.52 · 8.52±0.10(Predicted)
外見: 個体
色: ホワイトからオフホワイト
PH: 9 · ～9.0
由来生物: synthetic (chemical)
水溶解度: water: soluble
InChI: InChI=1/C9H12N2O6/c12-2-4-5(13)6(14)7(17-4)3-1-10-9(16)11-8(3)15/h1,4-7,12-14H,2H2,(H2,10,11,15,16)/t4-,5-,6-,7+/s3
InChIKey: PTJWIQPHWPFNBW-IZFRNLNUNA-N
SMILES: O[C@@H]1[C@@H]([C@@H](CO)O[C@H]1C1=CNC(=O)NC1=O)O |&1:1,2,3,7,r|

安全と法規制

安全情報は参考情報です。供給元の安全データシート（SDS）、適用法令、専門家による評価に代わるものではありません。

GHS分類

GHS ClassificationNot Classified

危険有害性情報

Hazard Classes and CategoriesNot Classified

安全データ

wgk: WGK 3
hs_code: 2934.99.9001
ストレージクラス: 13 - Non Combustible Solids

化学と産業

薬理情報

Tissue LocationsPlacenta

Cellular LocationsCytoplasm

応用分野 · 3 件

解説プソイドウリジンC,ピリミジンヌクレオシドの一種．ほかのヌクレオシドと異なり，ウラシルの5位のC原子とリボースの1位のC原子がC-C結合(C-グリコシド)しているのが特徴である．この種のヌクレオシド抗生物質も2，3種類知られている．tRNAの微量成分として含まれている．融点222～223 ℃．[α]D－3.0°(水)．λmax 262 nm(ε 7.9×103，pH 7.0)，287 nm(ε 7.8×103，pH 12.0)．pKa 8.9．[CAS 1445-07-4]"森北出版「化学辞典（第2版）

説明β-Pseudouridine is the C-5 glycoside isomer of the nucleoside uridine. It is formed when uridine in RNA undergoes site-specific isomerization by a pseudouridine synthase enzyme. Pseudouridine is found in tRNAs from bacteria, archaea, and eukaryotes. In vitro, it reduces the number of X-ray-induced chromosomal aberrations in human lymphocytes isolated from whole blood in a dose-dependent manner.

使用An isomer of the nucleoside uridine found in all species and in many classes of RNA except mRNA. It is formed by enzymes called Ψ synthases, which post-transcriptionally isomerize specific uridine residues in RNA in a process termed pseudouridylation. Studies suggest that β-Pseudouridine reduces radiation-induced chromosome aberrations in human lymphocytes.

上流・下流製品情報

上流原料

2,4(1H,3H)-Pyrimidinedione, 5-[5-O-[(1,1-dimethylethyl)diphenylsilyl]-2,3-O-(1-methylethylidene)-β-D-ribofuranosyl]-D-Ribitol, 1,4-anhydro-1-C-(2,4-dimethoxy-5-pyrimidinyl)-, (1S)-5-(α-D-リボフラノシル)-2,4(1H,3H)-ピリミジンジオン 2,4(1H,3H)-Pyrimidinedione, 5-[2,3-O-(1-methylethylidene)-β-D-ribofuranosyl]-2,4(1H,3H)-Pyrimidinedione, 5-[5-O-[(1,1-dimethylethyl)diphenylsilyl]-β-D-ribofuranosyl]-5-O-(1-Methoxy-1-Methylethyl)-2,3-O-(1-Methylethylidene)-D-ribonic Acid γ-Lactone 2-アミノ-5-β-D-リボフラノシルピリミジン-4(3H)-オン D-(+)-リボノ-1,4-ラクトン

サプライヤー100 社

常州帝通化工有限公司+86-0519-88298848 · [email protected]

梯希爱(上海)化成工业发展有限公司021-67121386 · [email protected]

苏州华赛生物工程技术有限公司0512-89581819; 18915732708 · [email protected]

上海遐瑞医药科技有限公司+86-021-61551413 · [email protected]

T&W GROUP021-61551611 13296011611 · [email protected]

補足説明

定義ChEBI: Pseudouridine is a C-glycosyl pyrimidine that consists of uracil having a beta-D-ribofuranosyl residue attached at position 5. The C-glycosyl isomer of the nucleoside uridine. It has a role as a fundamental metabolite.

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基本情報

CAS: 1445-07-4
標準SMILES: O=c1[nH]cc([C@@H]2O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)[nH]1
InChIKey: PTJWIQPHWPFNBW-GBNDHIKLSA-N
分子式: C9H12N2O6
平均分子量: 244.2 g/mol
単同位体質量: 244.06953611

概要

名称と識別子

優先名称: Pseudouridine
IUPAC: 5-[(2S,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-1H-pyrimidine-2,4-dione
現地名: プソイドウリジンC
英語名: Pseudouridine
分子式: C9H12N2O6
分子量: 244.2

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RefChem:177010978-484-6beta-Pseudouridine5-Ribosyluracilbeta-D-Pseudouridine5-((2S,3R,4S,5R)-3,4-Dihydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dionePseudouridine CPseudouridin

データベース識別子

CAS: 1445-07-4
PubChem CID: 15047
ChEMBL: CHEMBL3144027
ChEBI: CHEBI:17802
UNII: 7R0R6H6KEG
EC Number: 978-484-6
Nikkaji: J20.385H

物性

構造計算による物性

XLogP: -2.8
極性表面積: 128 Å²
水素結合供与体数: 5
水素結合受容体数: 6
回転可能結合数: 2
重原子数: 17
形式電荷: 0
複雑度: 382

実験および物理化学的性質

Physical DescriptionSolid

Collision Cross Section · 3 件

150.77 Å² [M-H]- [CCS Type: DT; Method: stepped-field]

159 Å² [M+Na]+ [CCS Type: DT; Method: single field calibrated with Agilent tune mix (Agilent)]

150.3 Å² [M-H]-

物理化学的性質

融点: 222 °C · 222 °C
比重(密度): 1.641 · 1.641±0.06 g/cm3(Predicted)
貯蔵温度: Inert atmosphere,Room Temperature
溶解性: メタノール（ごくわずか、加熱）、水（わずかに、超音波処理、加熱）
酸解離定数(Pka): 8.52 · 8.52±0.10(Predicted)
外見: 個体
色: ホワイトからオフホワイト
PH: 9 · ～9.0
由来生物: synthetic (chemical)
水溶解度: water: soluble
InChI: InChI=1/C9H12N2O6/c12-2-4-5(13)6(14)7(17-4)3-1-10-9(16)11-8(3)15/h1,4-7,12-14H,2H2,(H2,10,11,15,16)/t4-,5-,6-,7+/s3
InChIKey: PTJWIQPHWPFNBW-IZFRNLNUNA-N
SMILES: O[C@@H]1[C@@H]([C@@H](CO)O[C@H]1C1=CNC(=O)NC1=O)O |&1:1,2,3,7,r|

安全と法規制

安全情報は参考情報です。供給元の安全データシート（SDS）、適用法令、専門家による評価に代わるものではありません。

GHS分類

GHS ClassificationNot Classified

危険有害性情報

Hazard Classes and CategoriesNot Classified

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wgk: WGK 3
hs_code: 2934.99.9001
ストレージクラス: 13 - Non Combustible Solids

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薬理情報

Tissue LocationsPlacenta

Cellular LocationsCytoplasm

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上流・下流製品情報

上流原料

サプライヤー100 社

常州帝通化工有限公司+86-0519-88298848 · [email protected]

梯希爱(上海)化成工业发展有限公司021-67121386 · [email protected]

苏州华赛生物工程技术有限公司0512-89581819; 18915732708 · [email protected]

上海遐瑞医药科技有限公司+86-021-61551413 · [email protected]

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