ビオチンHPDP
5-((3aS,4S,6aR)-2-Oxohexahydro-1H-thieno(3,4-d)imidazol-4-yl)-N-(6-(3-((pyridin-2-yl)disulfanyl)propanamido)hexyl)pentanamide
基本情報
- CAS
129179-83-5- 標準SMILES
O=C(CCCC[C@@H]1SC[C@@H]2NC(=O)N[C@@H]21)NCCCCCCNC(=O)CCSSc1ccccn1- InChIKey
QLPHBNRMJLFRGO-YDHSSHFGSA-N- 分子式
- C24H37N5O3S3
- 平均分子量
- 539.8 g/mol
- 単同位体質量
- 539.20585358
名称と識別子
- 優先名称
- 5-((3aS,4S,6aR)-2-Oxohexahydro-1H-thieno(3,4-d)imidazol-4-yl)-N-(6-(3-((pyridin-2-yl)disulfanyl)propanamido)hexyl)pentanamide
- IUPAC
- 5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-N-[6-[3-(pyridin-2-yldisulfanyl)propanoylamino]hexyl]pentanamide
- 現地名
- ビオチンHPDP
- 英語名
- BIOTIN HPDP
- 分子式
- C24H37N5O3S3
- 分子量
- 539.78
名称と別名
129179-83-5DTXSID905802805-((3aS,4S,6aR)-2-Oxohexahydro-1H-thieno(3,4-d)imidazol-4-yl)-N-(6-(3-((pyridin-2-yl)disulfanyl)propanamido)hexyl)pentanamide5-[(3aS,4S,6aR)-2-Oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-N-(6-{3-[(pyridin-2-yl)disulfanyl]propanamido}hexyl)pentanamideRefChem:1072305DTXCID40531045Biotin-HPDPBiotin HPDPMFCD00078541SCHEMBL13056335-((3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)-N-(6-(3-(pyridin-2-yldisulfanyl)propanamido)hexyl)pentanamide5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-N-[6-[3-(pyridin-2-yldisulfanyl)propanoylamino]hexyl]pentanamide
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ビオチンHPDPビオチン-HPDPHPDP-BiotinBiotin Impurity 31Biotin HPDP,BiotinHPDPCiprofibrate Impurity 6Biotin-HPDP, 10 mM in DMSOMacamide Impurity 11(Biotin HPDP)Biotin-HPDP, Sulfhydryl-reactive biotinylation reagentN-[6-(Biotinamido)hexyl]-3’-(2-pyridyldithio)propionamide
HY-136769B5749CS-0133567Pyridyldisulfide-biotinC24H37N5O3S3Biotin?HPDPPyridyldithiol-biotinorb1218959
データベース識別子
- CAS
129179-83-5- PubChem CID
- 15949894
- DTXSID
DTXSID90580280- Nikkaji
- J1.975.525H
物性
構造計算による物性
- XLogP
- 2.3
- 極性表面積
- 188 Ų
- 水素結合供与体数
- 4
- 水素結合受容体数
- 7
- 回転可能結合数
- 17
- 重原子数
- 35
- 形式電荷
- 0
- 複雑度
- 672
物理化学的性質
- 融点
- 160 · 160-163°C
- 沸点
- 876 · 876.0±65.0 °C(Predicted)
- 比重(密度)
- 1.28 · 1.28
- 貯蔵温度
- -20 °C · -20°C Freezer
- 溶解性
- 2 O; · insoluble in H2O; ≥101.4 mg/mL in DMSO; ≥8.29 mg/mL in EtOH with ultrasonic
- 酸解離定数(Pka)
- 13.9 · 13.90±0.40(Predicted)
- 外見
- powder to crystal
- 色
- White to Light yellow
- InChIKey
- QLPHBNRMJLFRGO-YDHSSHFGSA-N
- SMILES
- C1(=O)N[C@]2([H])[C@H](CCCCC(NCCCCCCNC(=O)CCSSC3=NC=CC=C3)=O)SC[C@]2([H])N1
化学的性質
化学的特性Pale Yellow Solid
安全と法規制
安全情報は参考情報です。供給元の安全データシート（SDS）、適用法令、専門家による評価に代わるものではありません。
安全データ
- wgk
- WGK 3
- hs_code
- 2934.99.4400
- ストレージクラス
- 11 - Combustible Solids
化学と産業
応用分野
説明Biotin-HPDP is a sulfhydryl-reactive biotinylation reagent that forms a reversible disulfide linkage. It is used to label protein cysteines and other substrates that contain sulfhydryl groups. Biotin-HPDP is also used in the biotin switch technique to tag S-nitrosylated (SNO) proteins, following reduction of SNO groups to thiols. Compounds that are tagged with biotin interact avidly with streptavidin-coupled beads, fluorophores, enzymes, etc. The interaction of biotin-HPDP with substrates containing sulfhydryl groups is easily performed at pH 6.5 to 7.5 in buffers such as PBS. The disulfide linkage that is formed between avidin and substrate can later by cleaved by a reducing agent, like dithiothreitol.
使用This compounds reacts specifically with thiol groups.
関連反応
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