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ロミデプシン

(1S,4S,7Z,10S,16E,21R)-7-Ethylidene-4,21-bis(1-methylethyl)-2-oxa-12,13-dithia-5,8,20,23-tetraazabicyclo(8.7.6)tricos-16-ene-3,6,9,19,22-pentone

HCID 56840936
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基本情報概要名称と識別子物性安全と法規制化学と産業関連反応化合物ノート
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基本情報

CAS
128517-07-7
標準SMILES
C/C=C1\NC(=O)[C@H]2CSSCC/C=C/[C@H](CC(=O)N[C@H](C(C)C)C(=O)N2)OC(=O)C(C(C)C)NC1=O
InChIKey
OHRURASPPZQGQM-WDCUYUQDSA-N
分子式
C24H36N4O6S2
平均分子量
540.7 g/mol
単同位体質量
540.20762723

概要

See also: Romidepsin (annotation moved to); Depsipeptides (annotation moved to).

名称と識別子

優先名称
(1S,4S,7Z,10S,16E,21R)-7-Ethylidene-4,21-bis(1-methylethyl)-2-oxa-12,13-dithia-5,8,20,23-tetraazabicyclo(8.7.6)tricos-16-ene-3,6,9,19,22-pentone
IUPAC
(1S,7Z,10S,16E,21R)-7-ethylidene-4,21-di(propan-2-yl)-2-oxa-12,13-dithia-5,8,20,23-tetrazabicyclo[8.7.6]tricos-16-ene-3,6,9,19,22-pentone
現地名
ロミデプシン
英語名
(1S,4Z,7S,10S,11E,20R)-4-ethylidene-7,20-dipropan-2-yl-9-oxa-15,16-dit hia-3,6,18,21-tetrazabicyclo[8.7.6]tricos-11-ene-2,5,8,19,22-pentone
分子式
C24H36N4O6S2
分子量
540.7

名称と別名

NSC 630176NCGC00229513-01Romidepsin [USAN:INN]UNII-CX3T89XQBKSCHEMBL10292909(1S,4S,7Z,10S,16E,21R)-7-Ethylidene-4,21-bis(1-methylethyl)-2-oxa-12,13-dithia-5,8,20,23-tetraazabicyclo(8.7.6)tricos-16-ene-3,6,9,19,22-pentoneCyclo((2Z)-2-amino-2-butenoyl-L-valyl-(3S,4E)-3-hydroxy-7-mercapto-4-heptenoyl-D-valyl-D-cysteinyl), cyclic (3->5)-disulfideTox21_112907AKOS040758882EBC-459056CAS-128517-07-7T6006
名称をさらに表示
ロミデプシンロミデプシン (JAN)(1S,4S,7Z,10S,16E,21R)-7-エチリデン-4,21-ビス(プロパン-2-イル)-2-オキサ-12,13-ジチア-5,8,20,23-テトラアザビシクロ[8.7.6]トリコサ-16-エン-3,6,9,19,22-ペンタオンシクロ[D-Val-D-Cys(1)-[(Z)-3-メチルDha-]-L-Val-[(3S)-3-[(E)-4-メルカプト(1)-1-ブテニル]-2-デアミノSer*-]]FK-228クロマダックスRomidepsinFK228depsipeptideRomidisinCS-972

物性

構造計算による物性

XLogP
2.2
極性表面積
193 Ų
水素結合供与体数
4
水素結合受容体数
8
回転可能結合数
2
重原子数
36
形式電荷
0
複雑度
905

物理化学的性質

融点
219 · 219-224°C
沸点
942.8 · 942.8±65.0 °C(Predicted)
比重(密度)
1.174 · 1.174
貯蔵温度
-20 °C · -20°C
溶解性
DMSO に可溶 (最大 10 mg/ml)。
酸解離定数(Pka)
11.33 · 11.33±0.60(Predicted)
外見
粉
色
白からベージュ
安定性
2 · 購入日から2年間安定です。この DMSO 溶液は、-20°C で 1 か月間保存できます。
InChIKey
OHRURASPPZQGQM-RGTIDSFYNA-N
SMILES
[C@@]12([H])NC(=O)[C@@]([H])(C(C)C)NC(=O)C[C@@]([H])(C=CCCSSC1)OC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)/C(=C/C)/NC2=O |c:16,&1:0,5,14,26,r|

化学的性質

化学的特性Pale Yellow Solid

安全と法規制

安全情報は参考情報です。供給元の安全データシート(SDS)、適用法令、専門家による評価に代わるものではありません。

安全データ

wgk
WGK 3
rtecs
YV9399000
毒性
mouse,LD50,intraperitoneal,6400ug/kg (6.4mg/kg),Journal of Antibiotics. Vol. 47, Pg. 301, 1994.
hs_code
29349990
ストレージクラス
11 - Combustible Solids

化学と産業

応用分野 · 2 件

説明The U.S. FDA approved romidepsin (also referredto as FK228) in 2009 for the treatment of cutaneous T-cell lymphoma (CTCL) for patients who received at least one systemic therapy. Romidepsin is a natural product that was first isolated from the fermentation broth of C. violaceum. Romidepsin is the second histone deacetylase (HDAC) inhibitor approved for CTCL, the other being vorinostat,whichwas approved by the FDA in 2006. Unlike vorinostat which is a pan-HDAC inhibitor, romidepsin shows modest selectivity for class I HDACs in in vitro assays. It has been shown that after romidepsin enters the cytoplasm, the disulfide bond is cleaved by glutathione to release the sulfhydryl groupwhich chelateswith the activesite zinc of class IHDACs and inhibits the enzymatic activity at nanomolar concentrations. Although romidepsin inhibits class I HDACs, it is 17–23 times less potent as the parent than the corresponding reduced form at each isozyme. For example, the IC50 of romidepsin at HDAC1 is 36±16nM while that of the reduced form is IC50=1.6± 0.9nM.Romidepsinhasalsobeenshownto induce cell cycle arrest, differentiation, and apoptosis in tumor cells by mechanisms that cannot be completely explained by HDAC inhibition alone.

使用Labelled Romidepsin (R425060). Romidepsin is a histone deacetylase inhibitor that can alter chromatin structure and gene transcription leading to multiple changes in cellular protein production. This may result in cell cycle arrest and tumor growth inhibition. Romidepsin has shown anti-proliferative activity in vitro against multiple mouse and human tumor cell lines and in vivo in human tumor xeno graft models. Romidepsin can be administered with a second agent, such as a cytotoxic agent, a steroidal agent, a proteasome inhibitor, or a kinase inhibitor.

補足説明

定義ChEBI: A cyclodepsipeptide consisting of the cyclic disulfide of (2Z)-2-aminobut-2-enoyl, L-valyl, (3S,4E)-3-hydroxy-7-sulfanylhept-4-enoyl, D-valyl and D-cystei yl residues coupled in sequence and cyclised head-to tail.

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GSI-001
FR 901228
(1S,10S,16E,21R)-7-Ethylidene-4,21-di(propan-2-yl)-2-oxa-12,13-dithia-5,8,20,23-tetraazabicyclo[8.7.6]tricos-16-ene-3,6,9,19,22-pentoneL-Valine, N-((3S,4E)-3-hydroxy-7-mercapto-1-oxo-4-heptenyl)-D-valyl-D-cysteinyl-(2Z)-2-amino-2-butenoxyl-, (4-1)-lactone, cyclic (1-2)-disulfide

データベース識別子

CAS
128517-07-7
PubChem CID
56840936
DTXSID
DTXSID8048579
Nikkaji
J575.851C