シチジン5'-二りん酸

Cytidine Diphosphate

HCID 6132CAS 63-38-7

基本情報

標準SMILES: Nc1ccn([C@@H]2O[C@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)O)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)n1
InChIKey: ZWIADYZPOWUWEW-XVFCMESISA-N
分子式: C9H15N3O11P2
平均分子量: 403.18 g/mol
単同位体質量: 403.01818156

概要

CDP is a pyrimidine ribonucleoside 5'-diphosphate having cytosine as the nucleobase. It has a role as a mouse metabolite and an Escherichia coli metabolite. It is a cytidine 5'-phosphate and a pyrimidine ribonucleoside 5'-diphosphate. It is a conjugate acid of a CDP(3-).

名称と識別子

優先名称: Cytidine Diphosphate
IUPAC: [(2R,3S,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate
現地名: シチジン5'-二りん酸
英語名: Sulbactum Sodium
分子式: C9H15N3O11P2
分子量: 403.18

名称と別名

Cytidine diphosphatecytidine-5'-diphosphate63-38-75'-CDP1ZH821MXU5DTXSID501014481[(2R,3S,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphateDiphosphate, Cytidine((2R,3S,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl)methyl phosphono hydrogen phosphateRefChem:130309DTXCID001437064disodium;((5-(4-amino-2-keto-pyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxy-tetrahydrofuran-2-yl)methoxy-oxido-phosphoryl) hydrogen phosphate

名称をさらに表示

シチジン5'-二りん酸シチジン補酵素シチジンコエンザイムシチジン5'-(二りん酸三水素)シチジン5'二リン酸[({[(2R,3S,4R,5R)-5-(4-アミノ-2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-1-イル)-3,4-ジヒドロキシオキソラン-2-イル]メトキシ}(ヒドロキシ)ホスホリル)オキシ]ホスホン酸シチジン5′-O-ジホスファートシチジン5′-二りん酸5′-CDP,2NaCyclazosin Impurity 2Citicoline Impurity 11Cytidine 5'-(trihydrogen pyrophosphate)

Cytidine 5'-diphosphateCytidine 5'-(trihydrogen diphosphate)Cytidine coenzymeCytidine 5'-pyrophosphateCDPCytidine 5'-diphosphoric acidCytidine 5'-pyrophosphoric acidSulbactum sodium

データベース識別子

CAS: 63-38-7
PubChem CID: 6132
DTXSID: DTXSID501014481
ChEMBL: CHEMBL425252
ChEBI: CHEBI:17239
UNII: 1ZH821MXU5
EC Number: 200-557-1
Nikkaji: J150.290E

物性

構造計算による物性

XLogP: -4.5
極性表面積: 222 Å²
水素結合供与体数: 6
水素結合受容体数: 11
回転可能結合数: 6
重原子数: 25
形式電荷: 0
複雑度: 690

実験および物理化学的性質

DrugsPharmaceuticals -> Listed in ZINC15

LogP2.44

Physical DescriptionSolid

Collision Cross Section · 3 件

179.9 Å² [M+Na]+ [CCS Type: DT; Method: single field calibrated with ESI Low Concentration Tuning Mix (Agilent)]

171.31 Å² [M-H]- [CCS Type: DT; Method: single field calibrated with Agilent tune mix (Agilent)]

176.3 Å² [M-2H+Na]-

物理化学的性質

融点: 183 °C · 183 °C (decomp)
沸点: 767.4 · 767.4±70.0 °C(Predicted)
比重(密度): 2.35 · 2.35±0.1 g/cm3(Predicted)
貯蔵温度: -20 °C · Keep in dark place,Inert atmosphere,Store in freezer, under -20°C
酸解離定数(Pka): 1.04 · 1.04±0.50(Predicted)

安全と法規制

安全データ

注意喚起語: 警告
危険有害性情報: コード危険有害性情報危険有害性クラス区分注意喚起語シンボル P コード H302

化学と産業

薬理情報

Cellular LocationsMitochondria

Metabolite PathwaysBeta Ureidopropionase Deficiency

サプライヤー47 社

北京华美互利生物化工010-56205725 · [email protected]

湖南韵邦生物科技股份有限公司85561037 15386497078 · [email protected]

上海哲研生物科技有限公司021-18017610038 18017610038 · [email protected]

河南赢创生物科技有限公司16650615803 · [email protected]

广州隽唐科技有限公司020-36607679 13502246435 · [email protected]

補足説明

定義ChEBI: A pyrimidine ribonucleoside 5'-diphosphate having cytosine as the nucleobase.