基本情報
- CAS
1123-95-1- 標準SMILES
Nc1[nH]c(=O)ncc1CO- InChIKey
RYVNIFSIEDRLSJ-UHFFFAOYSA-N- 分子式
- C5H7N3O2
- 平均分子量
- 141.13 g/mol
- 単同位体質量
- 141.05382648
概要
5-(hydroxymethyl)cytosine is a nucleobase analogue that is cytosine in which the hydrogen at position 5 is replaced by a hydroxymethyl group. It has a role as a mouse metabolite and a human metabolite. It is an aromatic primary alcohol, a pyrimidone, an aminopyrimidine and a nucleobase analogue. It is functionally related to a cytosine.
名称と識別子
- 優先名称
- 5-(Hydroxymethyl)cytosine
- IUPAC
- 6-amino-5-(hydroxymethyl)-1H-pyrimidin-2-one
- 現地名
- 5-(ヒドロキシメチル)シトシン
- 英語名
- 5-Hydroxymethylcytosine
- 分子式
- C5H7N3O2
- 分子量
- 141.13
名称と別名
5-Hydroxymethylcytosine1123-95-15-(hydroxymethyl)cytosine4-Amino-5-(hydroxymethyl)-2(1H)-pyrimidinone6CD2RLN1NK2(1H)-Pyrimidinone, 4-amino-5-(hydroxymethyl)-DTXSID70149990NSC-27368CHEBI:767925-hydroxylmethylcytosineRefChem:102910DTXCID0072481
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5-(ヒドロキシメチル)シトシン4-アミノ-5-ヒドロキシメチル-2(1H)-ピリミジノン4-アミノ-5-(ヒドロキシメチル)-2(1H)-ピリミジノン5-ヒドロキシメチルシトシン5hmC5-HYDROXYMETHYLCYTOSHM-cytosine, 10 mM in DMSO5-Hydroxymethylcytosinefreebase6-amino-5-methylol-1H-pyrimidin-2-one4-amino-5-methylol-3H-pyrimidin-2-one5-(Hydroxymethyl)Cytosine Hydrochloride
4-amino-5-(hydroxymethyl)pyrimidin-2-ol6-amino-5-(hydroxymethyl)-1H-pyrimidin-2-one4-amino-5-(hydroxymethyl)pyrimidin-2(1H)-one5-HYDROXYMETHYL CYTOSINEMFCD000473695-pyrimidinemethanol, 4-amino-2-hydroxy-4-Amino-2-hydroxy-5-hydroxymethylpyrimidineHM-cytosine
データベース識別子
物性
構造計算による物性
- XLogP
- -1.5
- 極性表面積
- 87.7 Ų
- 水素結合供与体数
- 3
- 水素結合受容体数
- 3
- 回転可能結合数
- 1
- 重原子数
- 10
- 形式電荷
- 0
- 複雑度
- 219
物理化学的性質
- 融点
- 299.85 °C · >299.85°C
- 沸点
- 258.15 °C · 258.15°C (rough estimate)
- 比重(密度)
- 1.3818 · 1.3818 (rough estimate)
- 屈折率
- 1.619 · 1.6190 (estimate)
- 貯蔵温度
- 2 · under inert gas (nitrogen or Argon) at 2–8 °C
- 溶解性
- DMSO (少量)、メタノール (少量、加熱、超音波処理)
- 外見
- 個体
- 酸解離定数(Pka)
- 8.61 · 8.61±0.10(Predicted)
- 色
- 淡い黄色からベージュ
- 主な用途
- 細胞分析臨床研究一般的な分析ライフサイエンスおよびバイオ医薬品メタボロミクス
- InChI
- InChI=1S/C5H7N3O2/c6-4-3(2-9)1-7-5(10)8-4/h1,9H,2H2,(H3,6,7,8,10)
- InChIKey
- RYVNIFSIEDRLSJ-UHFFFAOYSA-N
- SMILES
- OCC1=CNC(N=C1N)=O
化学的性質
化学的特性Grey solid
安全と法規制
安全情報は参考情報です。供給元の安全データシート（SDS）、適用法令、専門家による評価に代わるものではありません。
安全データ
- wgk
- 3
- hs_code
- 29335990
- hazard_code
- Xi
- hazard_note
- Irritant
- safety_code
- 24/25
- ストレージクラス
- 11 - Combustible Solids
化学と産業
応用分野
解説C5H7N3O2(141.13)．5-(ヒドロキシメチル)シトシンは，大腸菌バクテリオファージT系のうち，偶数番号のもの(T2，T4，T6)のDNAにのみ見いだされるピリミジン塩基．白色の粉末．融点200 ℃ 以上．λmax 279 nm(ε 9700，0.1 mol L－1 塩酸)，269.5 nm(pH 7.4)，283.5 nm(0.1 mol L－1 水酸化ナトリウム)．5位のヒドロキシメチル基にグルコースがグリコシド結合していることが多く，大腸菌内の制限酵素による攻撃を防ぐ意味があるといわれている．森北出版「化学辞典（第2版）
使用5-(Hydroxymethyl)cytosine is a DNA pyrimidine nitrogen base.It may regulate gene expression or prompt DNA demethylation. 5-Hydroxymethylcytosine may be especially important in the central nervous system, as it is found in very high levels there.
上流・下流製品情報
上流原料
下流製品
サプライヤー86 社
北京华美互利生物化工010-56205725 · [email protected]
陕西缔都新材料有限公司
関連反応
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化合物ノート
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