基本情報
- CAS
791570-52-0- 標準SMILES
O=c1[nH]c(=O)n([C@H]2C[C@H](O)[C@@H](COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O2)cc1C#CCNS(=O)(=O)c1ccc(C2=c3cc4c5c(c3Oc3c2cc2c6c3CCCN6CCC2)CCC[N+]=5CCC4)c(S(=O)(=O)[O-])c1- InChIKey
IBVCSSOEYUMRLC-GABYNLOESA-N- 分子式
- C43H46N5O20P3S2
- 平均分子量
- 1,109.9 g/mol
- 単同位体質量
- 1,109.13904221
名称と識別子
- 優先名称
- Texas Red-5-dUTP
- IUPAC
- 5-[3-[1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-[[hydroxy-[hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxyphosphoryl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-2,4-dioxopyrimidin-5-yl]prop-2-ynylsulfamoyl]-2-(3-oxa-23-aza-9-azoniaheptacyclo[17.7.1.15,9.02,17.04,15.023,27.013,28]octacosa-1(27),2(17),4,9(28),13,15,18-heptaen-16-yl)benzenesulfonate
- 英語名
- Chromatide(TM) texas red(R)-5-dUTP
- 分子式
- C43H46N5O20P3S2
- 分子量
- 1109.9
名称と別名
Texas Red-5-dUTP791570-52-0DTXSID208584442'-Deoxy-5-(3-{[4-(2,3,6,7,12,13,16,17-octahydro-1H,5H,11H,15H-pyrido[3,2,1-ij]pyrido[1'',2'',3'':1',8']quinolino[6',5':5,6]pyrano[2,3-f]quinolin-4-ium-9-yl)-3-sulfonatobenzene-1-sulfonyl]amino}prop-1-yn-1-yl)uridine 5'-(tetrahydrogen triphosphate)2'-Deoxy-5-{3-[4-(2,3,6,7,12,13,16,17-octahydro-1H,5H,11H,15H-pyrido[3,2,1-ij]pyrido[1'',2'',3'':1',8']quinolino[6',5':5,6]pyrano[2,3-f]quinolin-4-ium-9-yl)-3-sulfonatobenzene-1-sulfonamido]prop-1-yn-1-yl}uridine 5'-(tetrahydrogen triphosphate)TEXAS RED(R)-5-DUTPChromatide(TM) texas red(R)-5-dUTPTexas Red-5-dUTP TriaMMoniuM MonosodiuM SaltTexas Red-5-dUTP (85%) TriaMMoniuM MonosodiuM Salt9-[4-[[[3-[1-[2-Deoxy-5-O-[hydroxy[[hydroxy(phosphonooxy)phosphinyl]oxy]phosphinyl]-β-D-erythro-pentofuranosyl]-1,2,3,4-tetrahydro-2,4-dioxo-5-pyriMidinyl]-2-propynyl]aMino]sulfonyl]-2-sulfophenyl]-2,3,6,7,12,13,16,17-octahydro-1H,5H,11H,15H-xantheno[2,3,4-ij:5,6,7-i'j']diquinolizin-18-iuM Inner Salt
データベース識別子
物性
構造計算による物性
- XLogP
- -2.8
- 極性表面積
- 374 Ų
- 水素結合供与体数
- 7
- 水素結合受容体数
- 22
- 回転可能結合数
- 13
- 重原子数
- 73
- 形式電荷
- 0
- 複雑度
- 2,870
物理化学的性質
- 融点
- 175 °C · >175°C (dec.)
- 貯蔵温度
- -20 °C · Hygroscopic, -20°C Freezer, Under Inert Atmosphere
- 溶解性
- メタノール、水（微量）
- 外見
- 個体
- 酸解離定数(Pka)
- -1.221 · -1.221±0.50(predicted)
- 色
- パープルからダークパープル
化学と産業
応用分野
使用Texas Red-5-dUTP is a fluorescence-labelled nucleotide analog. Texas Red-5-dUTP is used diagnostically for detection of rearranged SS18 in formalin-fixed, paraffin-embedded synovial sarcoma.
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