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5-(Hydroxymethyl)cytosine
5hmC · HM-cytosine · 5-HYDROXYMETHYLCYTOS · 5-Hydroxymethylcytosine · HM-cytosine, 10 mM in DMSO · 5-Hydroxymethylcytosinefreebase · 6-amino-5-methylol-1H-pyrimidin-2-one · 4-amino-5-methylol-3H-pyrimidin-2-one

식별자 및 물리적 특성
| CAS No. | 1123-95-1 |
|---|---|
| 분자식 | C5H7N3O2 |
| 평균 분자량 | 141.13 g/mol |
| 단동위원소 질량 | 141.05382648 g/mol |
| SMILES | Nc1[nH]c(=O)ncc1CO |
| InChIKey | RYVNIFSIEDRLSJ-UHFFFAOYSA-N |
| PubChem CID | 70751 |
| ChEBI | CHEBI:76792 |
| DTXSID | DTXSID70149990 |
화학 및 물리적 성질
| XLogP | -1.5 |
|---|---|
| 극성 표면적 | 87.7 |
| 수소 결합 공여자 수 | 3 |
| 수소 결합 수용자 수 | 3 |
| 회전 가능 결합 수 | 1 |
| 무거운 원자 수 | 10 |
| 형식 전하 | 0 |
| 복잡도 | 219 |
| 녹는점 | >299.85°C |
| 끓는 점 | 258.15°C (rough estimate) |
| 밀도 | 1.3818 (rough estimate) |
| 굴절률 | 1.6190 (estimate) |
| 저장 조건 | under inert gas (nitrogen or Argon) at 2–8 °C |
| 용해도 | DMSO(소량으로 용해), 메탄올(약간 용해됨, 가열, 초음파 처리) |
| 물리적 상태 | 고체 |
| pKa(산도 계수) | 8.61±0.10(Predicted) |
| 색상 | 연한 노란색~베이지색 |
| 주요 응용 | 세포 분석임상 연구일반 분석생명과학 및 바이오제약대사체학 |
| InChI | InChI=1S/C5H7N3O2/c6-4-3(2-9)1-7-5(10)8-4/h1,9H,2H2,(H3,6,7,8,10) |
| InChIKey | RYVNIFSIEDRLSJ-UHFFFAOYSA-N |
| SMILES | OCC1=CNC(N=C1N)=O |
화학적 성질
Grey solid
안전 및 규제
| 수질 위해 등급(WGK) | 3 |
|---|---|
| 관세 코드 | 29335990 |
| 위험 표시 | Xi |
| 안전 문구(S) | 24/25 |
| 위험 참고 사항 | Irritant |
| 저장 분류 | 11 - Combustible Solids |
용도
용도
5-(Hydroxymethyl)cytosine is a DNA pyrimidine nitrogen base.It may regulate gene expression or prompt DNA demethylation. 5-Hydroxymethylcytosine may be especially important in the central nervous system, as it is found in very high levels there.