Uridine Diphosphate (HCID 6031)

名称と識別子

優先名称: Uridine Diphosphate
IUPAC: [(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate
現地名: ウリジンピロりん酸
英語名: UDP
分子式: C9H14N2O12P2
分子量: 404.16

名称と別名

58-98-0URIDINE DIPHOSPHATEuridine-5'-diphosphateUridine PyrophosphateURIDINE_DIPHOSPHATE5G0F599A1YDTXSID001018933[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphateDiphosphate, UridinePyrophosphate, Uridine((2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl)methyl phosphono hydrogen phosphateRefChem:901480

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ウリジン二リン酸ウリジンピロりん酸二りん酸α-(5′-ウリジル)[({[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-ジオキソ-1,2,3,4-テトラヒドロピリミジン-1-イル)-3,4-ジヒドロキシオキソラン-2-イル]メトキシ}(ヒドロキシ)ホスホリル)オキシ]ホスホン酸ウリジン-5′-ピロリン酸ウリジン5′-ピロリン酸ウリジン5′-二りん酸ウリジン5′-O-ジホスファートuridinediphosphateUDP/Uridine DiphosphateUridine 5'-Diphosphate15'-URIDYLATE DIPHOSPHATE5′-UDP/Uridine 5′-Diphosphate5'-uridylate diphosphate (UDP)Uridine5'-Diphosphate Ester(UDP)uridine 5'-(trihydrogen pyrophosphate)

DTXCID501476946Uridine 5'-diphosphateUridine 5'-(trihydrogen diphosphate)UDP5'-UDPUridine 5'-pyrophosphate((2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-Dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl trihydrogen diphosphateUridine 5'-pyrophosphoric acid

データベース識別子

CAS: 58-98-0
PubChem CID: 6031
ChEMBL: CHEMBL130266
ChEBI: CHEBI:17659
UNII: 5G0F599A1Y
EC Number: 200-409-6
Nikkaji: J4.595K

物性

構造計算による物性

XLogP: -4.7
極性表面積: 212 Å²
水素結合供与体数: 6
水素結合受容体数: 12
回転可能結合数: 6
重原子数: 25
形式電荷: 0
複雑度: 675

実験および物理化学的性質

Physical DescriptionSolid

Collision Cross Section · 4 件

174 Å² [M+H]+ [CCS Type: TW; Method: calibrated with polyalanine]

176.5 Å² [M+H]+ [CCS Type: DT; Method: single field calibrated with Agilent tune mix (Agilent)]

181.7 Å² [M+Na]+ [CCS Type: DT; Method: single field calibrated with ESI Low Concentration Tuning Mix (Agilent)]；178.6 Å² [M+Na-2H]- [CCS Type: DT; Method: single field calibrated with ESI Low Concentration Tuning Mix (Agilent)]；172.9 Å² [M-H]- [CCS Type: DT; Method: single field calibrated with ESI Low Concentration Tuning Mix (Agilent)]；178.5 Å² [M+Na]+ [CCS Type: DT; Method: single field calibrated with ESI Low Concentration Tuning Mix (Agilent)]；176.9 Å² [M+H]+ [CCS Type: DT; Method: single field calibrated with ESI Low Concentration Tuning Mix (Agilent)]

178.1 Å² [M+Na]+；176.5 Å² [M+H]+；178.7 Å² [M-2H+Na]-；172.9 Å² [M-H]-；181.7 Å² [M+Na]+

物理化学的性質

貯蔵温度: -20 °C · Inert atmosphere,Store in freezer, under -20°C
比重(密度): 2.002 · 2.002±0.06 g/cm3(Predicted)
酸解離定数(Pka): 1.04 · 1.04±0.50(Predicted)

安全と法規制

安全データ

注意喚起語: 警告
危険有害性情報: コード危険有害性情報危険有害性クラス区分注意喚起語シンボル P コード H302

化学と産業

薬理情報

Tissue LocationsPlacenta；Prostate；Thyroid Gland

Cellular LocationsCytoplasm；Endoplasmic reticulum；Extracellular；Golgi apparatus；Lysosome；Mitochondria；Nucleus

Metabolite Pathways · 1 件

17-Beta Hydroxysteroid Dehydrogenase III Deficiency；Acetaminophen Metabolism Pathway；Acute Intermittent Porphyria；Amino Sugar Metabolism；Androgen and Estrogen Metabolism；Androstenedione Metabolism；Aromatase deficiency；Artemether Metabolism Pathway；Beta Ureidopropionase Deficiency；Celecoxib Action Pathway；Total 63 pathways, visit the HMDB page for details

応用分野

解説ウリジン二リン酸，生物体内に存在する化学物質。UDP（uridine diphosphate）と略記する。ウラシル、リボース、2分子のリン酸から構成されるピリミジンヌクレオチドである。UDPは、生物がショ糖、グリコーゲンなどの糖類を合成する際、また単糖類が相互に変換する際に重要な働きをする多くの糖ヌクレオチドの構成成分である。また、RNA（リボ核酸）合成の前駆物質の一つであるUTP（ウリジン三リン酸）はUDPを経て合成される。