ゲンタマイシンC1標準品

Gentamicin C1

HCID 72395

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基本情報

CAS: 25876-10-2
標準SMILES: CN[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H](O)[C@H](O[C@H]3O[C@H]([C@@H](C)NC)CC[C@H]3N)[C@@H](N)C[C@H]2N)OC[C@]1(C)O
InChIKey: CEAZRRDELHUEMR-CAMVTXANSA-N
分子式: C21H43N5O7
平均分子量: 477.6 g/mol
単同位体質量: 477.31624872

概要

gentamicin C1 has been reported in Liquidambar formosana with data available.

名称と識別子

優先名称: Gentamicin C1
IUPAC: (2R,3R,4R,5R)-2-[(1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-diamino-3-[(2R,3R,6S)-3-amino-6-[(1R)-1-(methylamino)ethyl]oxan-2-yl]oxy-2-hydroxycyclohexyl]oxy-5-methyl-4-(methylamino)oxane-3,5-diol
現地名: ゲンタマイシンC1標準品
英語名: (2R,3R,4R,5R)-2-[(1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-diamino-3-[(2R,3R,6S)-3-amino-6-[(1R)-1-methylaminoethyl]oxan-2-yl]oxy-2-hydroxy-cyclohexyl]oxy-5-methyl-4-methylamino-oxane-3,5-diol
分子式: C21H43N5O7
分子量: 477.6

名称と別名

Gentamicin C125876-10-2I904Y9FPPVDTXSID9023091(2R,3R,4R,5R)-2-[(1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-diamino-3-[(2R,3R,6S)-3-amino-6-[(1R)-1-(methylamino)ethyl]oxan-2-yl]oxy-2-hydroxycyclohexyl]oxy-5-methyl-4-(methylamino)oxane-3,5-diol(2R,3R,4R,5R)-2-[(1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-diamino-3-[(2R,3R,6S)-3-amino-6-[(1R)-1-(methylamino)ethyl]tetrahydropyran-2-yl]oxy-2-hydroxy-cyclohexoxy]-5-methyl-4-(methylamino)tetrahydropyran-3,5-diolCHEBI:27412(2R,3R,4R,5R)-2-((1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-diamino-3-((2R,3R,6S)-3-amino-6-((1R)-1-(methylamino)ethyl)oxan-2-yl)oxy-2-hydroxycyclohexyl)oxy-5-methyl-4-(methylamino)oxane-3,5-diol(2R,3R,4R,5R)-2-((1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-diamino-3-((2R,3R,6S)-3-amino-6-((1R)-1-(methylamino)ethyl)tetrahydropyran-2-yl)oxy-2-hydroxy-cyclohexoxy)-5-methyl-4-(methylamino)tetrahydropyran-3,5-diolRefChem:142888DTXCID50819987Gentamicin C1 Pentaacetate Salt

名称をさらに表示

ゲンタマイシンC1標準品ゲンタマイシンC1 PENTAACETATE SALTゲンタマイシンC1(2R,3R,4R,5R)-2-{[(1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-ジアミノ-3-{[(2R,3R,6S)-3-アミノ-6-[(1R)-1-(メチルアミノ)エチル]オキサン-2-イル]オキシ}-2-ヒドロキシシクロヘキシル]オキシ}-5-メチル-4-(メチルアミノ)オキサン-3,5-ジオール4-O-(2-アミノ-2,3,4,6,7-ペンタデオキシ-6-メチルアミノ-α-D-ribo-ヘプトピラノシル)-6-O-(3-デオキシ-4-メチル-3-メチルアミノ-β-L-アラビノピラノシル)-2-デオキシ-D-ストレプタミン4-O-[2-アミノ-6-(メチルアミノ)-2,3,4,6,7-ペンタデオキシ-α-D-erythro-ヘプトピラノシル]-6-O-[4-C-メチル-3-(メチルアミノ)-3-デオキシ-β-L-アラビノピラノシル]-2-デオキシ-D-ストレプタミンゲンタミシンC1gentamycin C1Gentamycin ImpurityGentamicin ImpurityGentamicin C1 sulfateGentamicin Impurity 1Gentamicin Impurity 11Gentamicin Solution C1,10ppmGentamycin Sulfate Impurity 6

AC1L2HZVUNII-I904Y9FPPVC21H43N5O751GGentamicin Impurity 14Gentamicin C1 pentaacetateGENTAMICIN C1 [MI]CHEMBL463809

データベース識別子

CAS: 25876-10-2
PubChem CID: 72395
DTXSID: DTXSID9023091
ChEMBL: CHEMBL463809
UNII: I904Y9FPPV
Nikkaji: J37.113K

物性

構造計算による物性

XLogP: -4.1
極性表面積: 200 Å²
水素結合供与体数: 8
水素結合受容体数: 12
回転可能結合数: 7
重原子数: 33
形式電荷: 0
複雑度: 636

実験および物理化学的性質

Collision Cross Section214.5 Å² [M+H]+ [CCS Type: TW; Method: calibrated with Waters Major Mix]

物理化学的性質

融点: 125 · 125-130°C
比旋光度: 25 · D25 +158°
沸点: 669.4 · 669.4±55.0 °C(Predicted)
比重(密度): 1.3 · 1.30±0.1 g/cm3(Predicted)
貯蔵温度: -20 °C · -20°C Freezer, Under Inert Atmosphere
溶解性: メタノール（わずかに）、水（わずかに、超音波処理）
酸解離定数(Pka): 13.29 · 13.29±0.70(Predicted)
外見: 個体
色: 白から黄色
安定性: 非常に吸湿性

化学的性質

化学的特性Off-White Solid

化学と産業

応用分野

使用Antibiotic complex consists of three closely related components, gentamicins C1, C2, C1a, and also Gentamicin A which differs from the other members of the complex but is similar to Kanamycin C. Antibacterial.